MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004842	C	6	6	203322	203327	0 %	0 %	0 %	100 %	56416532
4002	NC_004842	TGGT	2	8	203381	203388	0 %	50 %	50 %	0 %	56416532
4003	NC_004842	AAG	2	6	203469	203474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
4004	NC_004842	TGCC	2	8	203582	203589	0 %	25 %	25 %	50 %	56416532
4005	NC_004842	CTC	2	6	203619	203624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416532
4006	NC_004842	C	7	7	203628	203634	0 %	0 %	0 %	100 %	56416532
4007	NC_004842	GCC	2	6	203680	203685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416532
4008	NC_004842	CG	3	6	203717	203722	0 %	0 %	50 %	50 %	56416532
4009	NC_004842	C	6	6	203754	203759	0 %	0 %	0 %	100 %	56416532
4010	NC_004842	ATT	2	6	203798	203803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416532
4011	NC_004842	CTG	2	6	203885	203890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416532
4012	NC_004842	CGC	2	6	203921	203926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416532
4013	NC_004842	GAA	2	6	204218	204223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
4014	NC_004842	AGA	2	6	204348	204353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
4015	NC_004842	TAC	2	6	204439	204444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416533
4016	NC_004842	CAG	2	6	204520	204525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416533
4017	NC_004842	CT	3	6	204592	204597	0 %	50 %	0 %	50 %	56416533
4018	NC_004842	CA	3	6	204772	204777	50 %	0 %	0 %	50 %	56416533
4019	NC_004842	TCC	2	6	204890	204895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416533
4020	NC_004842	CAC	2	6	204940	204945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416533
4021	NC_004842	ACA	2	6	205244	205249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416533
4022	NC_004842	GTTG	2	8	205411	205418	0 %	50 %	50 %	0 %	56416533
4023	NC_004842	CGT	2	6	205443	205448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416533
4024	NC_004842	GCAT	2	8	205562	205569	25 %	25 %	25 %	25 %	56416533
4025	NC_004842	GAAC	2	8	205593	205600	50 %	0 %	25 %	25 %	56416533
4026	NC_004842	TCT	2	6	205815	205820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416533
4027	NC_004842	CAA	2	6	205896	205901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416533
4028	NC_004842	A	9	9	205972	205980	100 %	0 %	0 %	0 %	56416533
4029	NC_004842	ATAG	2	8	206037	206044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004842	CA	3	6	206045	206050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_004842	GGA	2	6	206091	206096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_004842	CTC	2	6	206291	206296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416534
4033	NC_004842	ACT	2	6	206340	206345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416534
4034	NC_004842	GTT	2	6	206347	206352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416534
4035	NC_004842	TGC	2	6	206356	206361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4036	NC_004842	GCT	2	6	206413	206418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4037	NC_004842	GCT	2	6	206436	206441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4038	NC_004842	TGG	2	6	206455	206460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416534
4039	NC_004842	CGA	2	6	206468	206473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4040	NC_004842	GT	3	6	206477	206482	0 %	50 %	50 %	0 %	56416534
4041	NC_004842	TGT	2	6	206502	206507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416534
4042	NC_004842	GTC	2	6	206522	206527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4043	NC_004842	GGAT	2	8	206594	206601	25 %	25 %	50 %	0 %	56416534
4044	NC_004842	TG	3	6	206610	206615	0 %	50 %	50 %	0 %	56416534
4045	NC_004842	TC	3	6	206635	206640	0 %	50 %	0 %	50 %	56416534
4046	NC_004842	CGT	2	6	206656	206661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
4047	NC_004842	CTGC	2	8	206701	206708	0 %	25 %	25 %	50 %	56416534
4048	NC_004842	CTC	2	6	206855	206860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416535
4049	NC_004842	TGC	2	6	206888	206893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416535
4050	NC_004842	GCA	2	6	206963	206968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416535
4051	NC_004842	GT	3	6	207088	207093	0 %	50 %	50 %	0 %	56416535
4052	NC_004842	CGGC	2	8	207180	207187	0 %	0 %	50 %	50 %	56416535
4053	NC_004842	TTG	2	6	207209	207214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416535
4054	NC_004842	CTAT	2	8	207342	207349	25 %	50 %	0 %	25 %	56416535
4055	NC_004842	TGA	2	6	207369	207374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
4056	NC_004842	AGA	2	6	207423	207428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416535
4057	NC_004842	TGTT	2	8	207473	207480	0 %	75 %	25 %	0 %	56416535
4058	NC_004842	AGC	2	6	207554	207559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416535
4059	NC_004842	TA	4	8	207637	207644	50 %	50 %	0 %	0 %	56416535
4060	NC_004842	TGA	2	6	207660	207665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
4061	NC_004842	T	6	6	207668	207673	0 %	100 %	0 %	0 %	56416535
4062	NC_004842	CTC	2	6	207726	207731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416535
4063	NC_004842	CTA	2	6	207754	207759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416535
4064	NC_004842	GAA	2	6	207850	207855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416535
4065	NC_004842	TTG	2	6	207857	207862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416535
4066	NC_004842	CGT	2	6	207919	207924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416535
4067	NC_004842	GAG	2	6	207932	207937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416535
4068	NC_004842	GAA	2	6	208048	208053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416535
4069	NC_004842	TGA	2	6	208152	208157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
4070	NC_004842	GTG	2	6	208232	208237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416535
4071	NC_004842	A	6	6	208282	208287	100 %	0 %	0 %	0 %	56416535
4072	NC_004842	ACC	2	6	208320	208325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416535
4073	NC_004842	GC	3	6	208378	208383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_004842	A	8	8	208409	208416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_004842	GCT	2	6	208461	208466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_004842	AGG	2	6	208556	208561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416536
4077	NC_004842	TG	3	6	208618	208623	0 %	50 %	50 %	0 %	56416536
4078	NC_004842	GTT	2	6	208760	208765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416536
4079	NC_004842	TCA	2	6	208767	208772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416536
4080	NC_004842	GAA	2	6	208855	208860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416536
4081	NC_004842	GCTC	2	8	208862	208869	0 %	25 %	25 %	50 %	56416536
4082	NC_004842	TGG	2	6	208906	208911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_004842	TCG	3	9	208920	208928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416537
4084	NC_004842	AGG	2	6	208939	208944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416537
4085	NC_004842	GC	3	6	208984	208989	0 %	0 %	50 %	50 %	56416537
4086	NC_004842	TGA	2	6	209003	209008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416537
4087	NC_004842	A	7	7	209016	209022	100 %	0 %	0 %	0 %	56416537
4088	NC_004842	GCTG	2	8	209025	209032	0 %	25 %	50 %	25 %	56416537
4089	NC_004842	AGA	2	6	209149	209154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416537
4090	NC_004842	TGG	2	6	209157	209162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416537
4091	NC_004842	TCGC	2	8	209209	209216	0 %	25 %	25 %	50 %	56416537
4092	NC_004842	ACAA	2	8	209260	209267	75 %	0 %	0 %	25 %	56416537
4093	NC_004842	AT	3	6	209271	209276	50 %	50 %	0 %	0 %	56416537
4094	NC_004842	GTT	2	6	209279	209284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416537
4095	NC_004842	CTT	2	6	209296	209301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416537
4096	NC_004842	ACA	2	6	209309	209314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416537
4097	NC_004842	GTGC	2	8	209324	209331	0 %	25 %	50 %	25 %	56416537
4098	NC_004842	AGA	2	6	209340	209345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416537
4099	NC_004842	CAA	2	6	209367	209372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416537
4100	NC_004842	TC	3	6	209378	209383	0 %	50 %	0 %	50 %	56416537
4101	NC_004842	AGT	2	6	209434	209439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416538
4102	NC_004842	ACC	2	6	209503	209508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416538
4103	NC_004842	CAGAA	2	10	209539	209548	60 %	0 %	20 %	20 %	56416538
4104	NC_004842	AGGTG	2	10	209550	209559	20 %	20 %	60 %	0 %	56416538
4105	NC_004842	TGGA	2	8	209584	209591	25 %	25 %	50 %	0 %	56416538
4106	NC_004842	GGAGCG	2	12	209595	209606	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	56416538
4107	NC_004842	CTG	2	6	209624	209629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416538
4108	NC_004842	ACC	2	6	209632	209637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416538
4109	NC_004842	GGCCGT	2	12	209733	209744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56416538
4110	NC_004842	TG	3	6	209784	209789	0 %	50 %	50 %	0 %	56416538
4111	NC_004842	ACG	2	6	209807	209812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416538
4112	NC_004842	GTG	2	6	209953	209958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416538
4113	NC_004842	GGA	2	6	209988	209993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416538
4114	NC_004842	CAG	2	6	210083	210088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416538
4115	NC_004842	ACG	2	6	210098	210103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416538
4116	NC_004842	AAG	2	6	210165	210170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416538
4117	NC_004842	GCT	2	6	210240	210245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416538
4118	NC_004842	T	6	6	210261	210266	0 %	100 %	0 %	0 %	56416538
4119	NC_004842	CCA	2	6	210287	210292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416538
4120	NC_004842	TCT	2	6	210340	210345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416538
4121	NC_004842	TTG	2	6	210359	210364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416538
4122	NC_004842	TGG	2	6	210383	210388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416538
4123	NC_004842	TTG	2	6	210395	210400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416538
4124	NC_004842	GT	3	6	210419	210424	0 %	50 %	50 %	0 %	56416538
4125	NC_004842	GTAG	2	8	210487	210494	25 %	25 %	50 %	0 %	56416538
4126	NC_004842	AAC	2	6	210514	210519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416538
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4128	NC_004842	TG	3	6	210599	210604	0 %	50 %	50 %	0 %	56416538
4129	NC_004842	A	6	6	210629	210634	100 %	0 %	0 %	0 %	56416538
4130	NC_004842	TTG	2	6	210722	210727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416538
4131	NC_004842	TAG	2	6	210815	210820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416538
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4134	NC_004842	AAAAT	2	10	211007	211016	80 %	20 %	0 %	0 %	56416538
4135	NC_004842	TGAT	2	8	211109	211116	25 %	50 %	25 %	0 %	56416538
4136	NC_004842	CTG	2	6	211231	211236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416538
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4139	NC_004842	TAG	2	6	211305	211310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416538
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4142	NC_004842	TAATG	2	10	211485	211494	40 %	40 %	20 %	0 %	56416538
4143	NC_004842	AAG	2	6	211495	211500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416538
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4158	NC_004842	GA	3	6	212208	212213	50 %	0 %	50 %	0 %	56416539
4159	NC_004842	TAC	2	6	212341	212346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416539
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4162	NC_004842	GAA	2	6	212447	212452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416539
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4231	NC_004842	T	6	6	215753	215758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_004842	TCT	2	6	215772	215777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416546
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4245	NC_004842	ATTT	2	8	216423	216430	25 %	75 %	0 %	0 %	56416546
4246	NC_004842	AAG	2	6	216441	216446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416546
4247	NC_004842	TTG	2	6	216568	216573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416546
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4249	NC_004842	AGT	2	6	216759	216764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416546
4250	NC_004842	AC	3	6	216892	216897	50 %	0 %	0 %	50 %	56416546
4251	NC_004842	TTC	2	6	217011	217016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416546
4252	NC_004842	GTT	2	6	217041	217046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416546
4253	NC_004842	AGT	2	6	217127	217132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416546
4254	NC_004842	TGC	2	6	217147	217152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416546
4255	NC_004842	GTT	2	6	217167	217172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416546
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4264	NC_004842	CGGTG	2	10	217982	217991	0 %	20 %	60 %	20 %	56416546
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4270	NC_004842	GCT	2	6	218543	218548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416546
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4273	NC_004842	GCT	2	6	218678	218683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416546
4274	NC_004842	CGT	2	6	218738	218743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416546
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4276	NC_004842	GCT	2	6	218886	218891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416546
4277	NC_004842	CT	3	6	219161	219166	0 %	50 %	0 %	50 %	56416546
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4280	NC_004842	GTT	2	6	219452	219457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416546
4281	NC_004842	ACG	2	6	219499	219504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416546
4282	NC_004842	AT	4	8	219549	219556	50 %	50 %	0 %	0 %	56416546
4283	NC_004842	CAC	2	6	219567	219572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416546
4284	NC_004842	TGA	2	6	219578	219583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416546
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4286	NC_004842	GAT	2	6	219747	219752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416546
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4296	NC_004842	A	6	6	220570	220575	100 %	0 %	0 %	0 %	56416547
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4322	NC_004842	GGAAG	2	10	222046	222055	40 %	0 %	60 %	0 %	56416547
4323	NC_004842	ATG	2	6	222071	222076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416547
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4333	NC_004842	TGC	2	6	222430	222435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416547
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4343	NC_004842	GC	3	6	223334	223339	0 %	0 %	50 %	50 %	56416547
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4357	NC_004842	GAG	2	6	224231	224236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416548
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4370	NC_004842	TTA	2	6	225216	225221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_004842	TAT	2	6	225236	225241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_004842	ATTG	2	8	225250	225257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_004842	CAG	2	6	232554	232559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416553
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